W zasięgu terytorialnym Nadleśnictwa  znajdują się 3 rezerwaty (Dybanka, Jezioro Szczawińskie i Jezioro Drzezno) oraz fragmenty otulin rezerwatów Jezioro Szczwińskie i Jezioro Drzezno. Na gruntach w zarządzie Nadleśnictwa Gostynin znajduję się  7 rezerwatów przyrody (Dolina Skrwy, Drzewce, Komory, Kresy Lubaty, Lucień, Osetnica) oraz otuliny dwóch reserwatów (Jezioro Szczawiński, Drzesno) Chronią one najcenniejsze fragmenty ekosystemów tego terenu.

Dolina Skrwy

Zgodnie z aktem powołującym, celem ochrony rezerwatu jest zachowanie unikalnego krajobrazu przełomu rzeki Skrwy Lewej oraz różnorodnych zbiorowisk leśnych z przewagą grądów.
Powierzchnia rezerwatu wskazana w akcie powołującym z 1987 r. wynosi 62,80 ha, natomiast wg aktualnych danych  obejmuje on powierzchnię 64,15 ha z czego 64,05 na gruntach Nadleśnictwa.
Rezerwat znajduje się w obrębie Gostynin, na terenie leśnictwa Sokołów

Drzewce

Zgodnie z aktem powołującym, celem ochrony rezerwatu jest zachowanie grądowych zbiorowisk leśnych położonych na terenie pradoliny rzeki Skrwy Lewej. Od strony wschodniej rezerwat graniczy z drogą z Gostynina do Kutna, a przez jego środek przebiega linia kolejowa Gostynin-Kutno. Od zachodu graniczy z doliną rzeki Skrwy Lewej.
Powierzchnia rezerwatu wskazana w akcie powołującym z 1987 r. wynosi 60,30 ha, natomiast wg aktualnych danych obejmuje on powierzchnię 61,73 ha. Rezerwat znajduje się w obrębie Gostynin, na terenie leśnictwa Drzewce

Komory

Zgodnie z aktem powołującym, celem ochrony rezerwatu jest zachowanie w stanie naturalnym zbiorowisk boru mieszanego, grądu z pomnikowymi dębami i olsu oraz nadbrzeżnych szuwarów.
Powierzchnia rezerwatu wskazana w akcie powołującym z 1987 r. wynosi 17,75 ha, natomiast wg aktualnych danych  obejmuje on powierzchnię 17,88 ha z czego 4,85ha na gruntach Nadleśnictwa. W 2025r. część rezerwatu została przekazana Wodom Polskim zgodnie z Decyzją Wojewody Mazowieckiego. 

Kresy

Zgodnie z aktem powołującym, celem ochrony rezerwatu jest ochrona różnorodnych leśnych zbiorowisk oligotroficznych zachowanych w stanie naturalnym oraz torfowisk wysokich.Nazwa rezerwatu nawiązuje do faktu, że był to teren graniczny pomiędzy Mazowszem a Kuja-wami. Granica została przesunięta w okolicach Duninowa w XII w., gdy przeszedł on wraz z okolicznymi lasami z kasztelani włocławskiej do gostynińskiej. Zachodnią granicę rezerwatu stanowi droga z Gostynina do Nowego Duninowa.
Powierzchnia rezerwatu wskazana w akcie powołującym z 1987 r. wynosi 182,35 ha powierzchniarezerwatu wg. aktualnych danych to 183ha z czego 182,35ha na gruntach Nadleśnictwa

Lubaty

Zgodnie z aktem powołującym, celem ochrony rezerwatu jest zachowanie naturalnego krajobrazu jeziora Lubaty wraz z otaczającymi je bagnami i lasami.
Rezerwat ten obejmuje część jeziora Lubaty, która znajduje się w zarządzie Nadleśnictwa, oraz otaczające je lasy. Pozostała część jeziora nie wchodzi w skład rezerwatu. Na jego terenie wystę-puje charakterystyczna strefowość roślinności. Począwszy od pozostałości zarastającego jeziora, poprzez pas szuwarowów trzcinowych, pło torfowiska przejściowego, bór bagienny, po las grądowy.
Powierzchnia rezerwatu wskazana w akcie powołującym z 1987 r. wynosi 33,50 ha, powierzchnia wg. aktualnych danych to 34,11 z tego 33,5 ha na gruntach Nadleśnictwa. 
Rezerwat znajduje się w obrębie Gostynin, na terenie leśnictwa Choinek

Lucień

Zgodnie z aktem powołującym, celem ochrony rezerwatu jest zachowanie naturalnych zbioro-wisk boru mieszanego oraz fragmentu olsu ze znacznym udziałem jesionu.
Rezerwat znajduje się na północnym brzegu Jeziora Lucieńskiego i obejmuje, poza obszarem leśnym, pas trzcinowisk pięćdziesięciometrowej szerokości. Na przyległych do rezerwatu tere-nach występują liczne ślady okopów i umocnień z okresu drugiej wojny światowej.
Powierzchnia rezerwatu wskazana w akcie powołującym z 1987 r. wynosi 55,44 ha, natomiast wg aktualnych danych obejmuje on powierzchnię 60,55 ha z tego 54,91ha na gruntach Nadleśnictwa.
Rezerwat znajduje się w obrębie Gostynin, na terenie leśnictwa Lucień. W 2025r. część rezerwatu została przekazana Wodom Polskim zgodnie z decyzją Wojewody Mazowieckiego.

Osetnica

Zgodnie z aktem powołującym, celem ochrony rezerwatu jest zachowanie unikalnego krajobrazu przełomu rzeki Osetnicy. Rezerwat położony jest w uroczysku Drzewce nad rzeką Osetnicą, do której przylega wschodnią krawędzią.
Powierzchnia rezerwatu wskazana w akcie powołującym z 1987 r. wynosi 54,66 ha, natomiast wg aktualnych danych obejmuje on powierzchnię 52,27 ha z czego 51,78ha na gruntach Nadleśnictwa.
Rezerwat znajduje się w obrębie Gostynin, na terenie leśnictwa Drzewce

Żródło: Program ochrony przyrody dla N-ctwa Gostynin na lata 2023-2032 oraz dane własne Nadleśnictwa Gostynin.